La intervención se realiza con anestesia local y de forma ambulatoria y dura entre seis y ocho horas. La duración del tratamiento depende en gran medida del tiempo necesario empleado para recoger las unidades foliculares. Para unas 2.500 unidades foliculares se necesitan unas 6 horas. Por regla general, el cirujano afeita la zona donante antes de extraer las unidades foliculares. Con las personas con el pelo largo se realiza la extracción en una zona que luego quedará cubierta por el propio pelo de alrededor.
No se trata de un procedimiento invasivo, sino todo lo contrario. Las llamadas zonas donantes se encuentran generalmente detrás y a los lados de la cabeza. La técnica FUE se basa en la realización de pequeñas inserciones capilares. Folículo a folículo, a través de esta técnica se conseguirá una implantación que nada tiene que ver con los antiguos tratamientos. Las unidades foliculares no son en sí mismas pelos o cabellos, sino conjuntos de ellos, frecuentemente de 2, 3 o 4 unidades, aunque también hay folículos que sólo contienen una unidad. La técnica FUE se realiza implantando folículo a folículo el cabello, desde las zonas donantes a las receptoras.